esse problema lançou o mito que o windows vista estragava os discos rigidos
podes-te informar mais em pormenor aqui, embora o teu problema seja apenas parecido ao descrito:
[url]http://support.microsoft.com/kb/931760[/url]
A forma mais rapida de resolver o teu problema é usar o software da marca do disco rigido para proceder a uma nova formatação "low level" do disco rigido.